胜生勇利（丰永利行 配音）是一名花样滑冰选手，在挑战赛中失利的他赶回了故乡九州，不知道自己一片迷惘的前途该何去何从。就在此时，一位名叫维克托（诹访部顺一 配音）的花滑教练出现在了勇利的面前，他曾是世界选手赛中连续五届称霸的王者，亦是勇利从小就憧憬的对象。
　　维克托的出现改写了勇利的未来，与此同时，样貌与品行严重不符的俄罗斯少年尤里（内山昂辉 配音）亦出现在了勇利的身边。在维克托的帮助下，勇利重新找回了对花滑的信心和热爱。乐观温柔的埃米尔（日野聪 配音）、沉默寡言却实力强大的奥塔别克（细谷佳正 配音）、内向羞涩的季光虹（本城雄太郎 配音），这些个性迥异的选手们和勇利一起活跃在赛场之中！

　　在一片宁静的小山村，少女渡濑明日菜（金元寿子 配音）时常站在山顶，用父亲留给她的神秘矿石作二极管，收听着来自外面世界的美妙音乐。在一次放学途中，明日菜遭到一头怪兽的袭击，关键时刻她被俊美少年瞬（入野自由 配音）救下，纯洁的友谊在少男少女之间开始萌芽。明日菜体味着友谊的甜蜜，却不知瞬在某天悄然离开人世。新来的男老师森崎龙司（井上和彦 配音）为孩子们讲述了死国的传说，明日菜这才意识到瞬正是来自另一个世界雅戈泰的人。森崎真实身份隶属某个神秘组织，他和明日菜的心中都有想要复活的人，于是经过一波三折，他们随着瞬的弟弟心一同来到了传说中的雅戈泰。
　　在这个绝美而凄惶的国度，他们展开了似乎永无止境的旅程……

KERORO剧场版5周年纪念，《超剧场版KERORO军曹 诞生！究极KERORO 奇迹的时空岛》即将启动！在KERORO最新剧场版中，将有阳光海滩、可爱的精灵，神秘的双胞胎和最凶邪灵登场，KERORO军曹将变身究极形态展开前所未有的超级大战。实力派歌手平原绫香也将为本作倾情献声。 　　一日，冬树收到了一个和KERORO一模一样的石像，为了解开这个秘密，KERORO和冬树开始了前所未有的大冒险……

　　拥有一头青色头发的男主角名字将叫作深井 青(フカイ·アオ，这名字在日语中带有“深青”的意义），是一名13岁少年。青的父亲兰顿·萨斯顿(Renton Thurston、レントン·サーストン)行踪不明，而母亲优莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美军带走了。由于继承了母亲的特殊基因，使得他能够看见人眼所不能看到的东西，如粒径为20nm大小的光粒子，红外线、紫外线等等（但在外太空这一特殊生理受到限制）。小时与诊疗所里的老医生深井 敏夫一同生活，现正在Generation Blue（蓝色世代）中。
　　女主角的名字将是阿拉塔·娜露，同样是13岁，是与青一同成长的青梅竹马。娜露因为童年时的事故而使拥有”ユタ”的力量(犹达，是日本冲绳以占卜为职业的灵媒师的名称)的眼睛醒觉。娜露有能够听懂珊瑚岩心声的特异功能，这是因为珊瑚岩的一部分在她体内成长，从某种程度上来说她和珊瑚岩存在部分融合，但正是因为这样，导致她自小身体虚弱，需要把氧气放入在手上的吸氧器，现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。
　　本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上，当时的磐户岛正进行著自治权回复运动，但在某一天，在岛上出现的珊瑚岩受到了宿敌白细胞G-Monster的攻击，而为了保护磐户岛，男主角青与人型IFO（Intelligent Flying Object）相遇，并与G-Monster战斗的故事就此展开。

　　KERORO剧场版5周年纪念，《超剧场版KERORO军曹 诞生！究极KERORO 奇迹的时空岛》即将启动！在KERORO最新剧场版中，将有阳光海滩、可爱的精灵，神秘的双胞胎和最凶邪灵登场，KERORO军曹将变身究极形态展开前所未有的超级大战。实力派歌手平原绫香也将为本作倾情献声。
　　一日，冬树收到了一个和KERORO一模一样的石像，为了解开这个秘密，KERORO和冬树开始了前所未有的大冒险……