《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
二十世纪四十年代，成都。大学生郑笑南是个血性青年，目睹无辜民众死于日机轰炸、在大学共产党员同学的影响下，弃笔从戎、投身疆场。与日军一次恶战中，川军小分队全军覆没，郑笑南被八路军搭救并成为其中一员。在这个大熔炉中，他磨练了意志、坚定了信仰，成长为一名共产党员。解放战争时期，郑笑南肩负党的使命重返川军回到成都，一场斗智斗勇的战斗由此展开。凭借抗日英雄的身份，他策动将领起义、保护进步人士，在紧要关头成功化解了危机，瓦解敌人阴谋，为成都的和平解放贡献出青春热血。黎明到来，解放军入城。郑笑南完成了使命，收获了爱情。
白牡丹（朱近桐 饰）不受感情的左右，决心要找出父亲的死因。随着白牡丹与阎良（朱旻昕 饰）多番博弈，两人决定联手寻找真相，他们之间的感情慢慢摩擦升温。但由于程峰（胡博文 饰）的插足，阎良与白牡丹之间不断产生误会。“杀父仇人”与“爱人”之间的角色的迥异，让白牡丹不得不面临艰难抉择的抉择。在此国仇家恨面前选择了为民族大义，联手共抗敌人。
曾是恋爱脑的林青春，第一次的人生太过失败，被恋爱七年的未婚夫和闺蜜联手算计，导致人房两失，却也意外让她开启二次人生。这一世拥有“预知”能力的她，暗暗立下“努力搬砖，才能买钻；远离风花，不会被耍”的人生目标。交友从不看家世背景的江楚恒，眼看林青春为了踢走前任、手撕绿茶，化身采茶战士，不由自主地屡屡伸出援手。命运让他们相遇，这次专注事业的林青春是否能收获新的爱情？
风光秀美的象牙山又迎来了极其闹腾的一年。嘚嘚瑟瑟的谢广坤（唐鉴军 饰）祖坟冒了青烟，王小蒙（毕畅 饰）居然给他生了龙凤胎孙伙计，这可把广坤时刻想要显摆的心美坏了，他大张旗鼓要搞庆祝，这期间却忽略了腾飞的感受。广坤的死对头刘能（王小利 饰）看在眼里，气在心头，一门心思地要干帮超，将希望全都寄托在闺女刘英的肚皮上。亲家赵四（刘晓光 饰）的生意越做越红火，眼瞅着就不把刘能放在眼里了，新的矛盾由此产生。香秀即将迎来新生命，但她和李大国的婚姻却走向破裂边缘。新的政策出台，让山庄的效益直线下降，王大拿（赵本山 饰）发愁之际，后院似乎也见到了火苗子。
该剧讲述了抗日战争时期新四军连长飞毛腿(蒲巴甲饰)和国军猛虎师师长曾文虎(徐僧饰)之间的革命兄弟情，以及热血儿女保家卫国的传奇故事。
