人妖共存又相争的世界，修炼术法、以斩妖除魔为己任的人们被称为妖师。国御妖师队长祁晓轩因一次意外结识了浪子虎子，二人共同踏上除魔卫道的旅途。现如今，世间已历经五百年的平静，妖魔们早已蠢蠢欲动，为他们的前路蒙上阴霾……
来吧，勇士们，在这里竞争吧、战斗吧！用你们的勇气和智慧取悦神明、赢得一切吧！这，就是『凹凸大赛』！这就是『凹凸世界』。 注：《凹凸世界 00》为试播集，分为上下两集。正片预计将在半年后推出。
故事发生在星风高中内，和泉隼斗（兴津和幸 配音）信心满满地参加了第一届学生会长的选举，他觉得凭借自己高超的实力，一举夺得学生会长的宝座简直不在话下。就在这个节骨眼上，一位名叫若菜羽衣（竹达彩奈 配音）的女生站在了他的对手席上，而羽衣主持的主张，竟然是荒唐的校园内恋爱自由化，紧接着，羽衣拿出了一大堆安全套，抛向了台下欢呼叫好的同学们。结果可想而知，羽衣当选了。 就这样，隼斗被迫成为了副会长，辅佐羽衣，然而，令隼斗没有想到的是，羽衣竟然跑到了自己的家里，还宣称自己是他的未婚妻。原来，两人的父母在很早之前就认识了，关系十分要好，两家的孩子就此结下娃娃亲。面对突如其来的学生会长未婚妻，隼斗会怎样应对呢？
因过去的心理阴影而以独自的别扭思考回路讴歌着“独自生活”的比企谷八幡，由于意外的事件而被生活指导担当教师平冢静带去“侍奉部”并加入其中。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃，以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同，从解决班上的人际关系问题到文化祭实行委员的运营，度过着解决各种案件的每一天。时至秋日，八幡等二年级学生前去修学旅行。此时，侍奉部接收到的委托究竟是！？随着新登场的一色彩羽的加入，他们的关系更加错综复杂。——八幡空虚的价值观也有了少许变化，在这些经验过后，他的高中生活又将迎来怎样的展开！？
