近未来的东京，有着一个为了夺取“最强武器”而建立的两大组织，以开发最强兵器为目的的导示重工，和通过操控遗传因子来制造优秀人类的NSWF。他们的共同目的只有一个，就是得到那个拥有着最强威力、并且只有通过被选中的女人才能操纵的终极武器“WITCHBLADE”。地震灾害的6年之后……天羽雅音、梨穂子 ，两人幸福的生活着，但是，等待着她们的却是，WITCHBLADE那暗之力的召唤，以及异常残酷的命运……
高山春香与好友园田优都升入了即将在3年后面临与别的学校合并而废校的美里西高中。喜欢优的春香，在优很快就能与其他同学相处亲密的情况下很嫉妒又吃醋。春香想让自己成为优“特别”的朋友，后来察觉到春香想法的优提议两人进行“绝对不会和其他人一起做的事情”，而对于春香来说，绝对不会和其他朋友做的“特别”的事情是“KISS”。。。 作品主要描绘了女孩子们快乐而又不失难过的青春。
立花萤（小松未可子 配音）是一位拥有着强烈正义感的少女。某日，她搬入了月城庄公寓，准备开始一个人的生活。让住在202室的萤没有想到的是，自己隔壁竟然住了一个名叫松岗正宗（前野智昭 配音）的牛郎，这个举止轻浮油腔滑调的男人没有给萤留下什么好印象。 矢岛鼎（堀江由衣 配音） 是萤唯一的朋友，某日，鼎告诉萤，自己被一个牛郎骗光了所有的积蓄，这让萤愤愤不平。萤冲到了牛郎店想要找到欺骗鼎的那个牛郎，为好友讨回公道，然而，令萤震惊的是，这个牛郎不是别人，正是自己的邻居松岗。而面对萤的挑衅，松岗竟然提出要用枪来一决胜负，就这样，萤被卷入了一个你争我斗的生存游戏之中。
在赌上学校存续的大学选拔队战役中胜利後，大洗女子学园战车道成员终於能好好享受和平悠闲的冬季。迎接三年级生毕业典礼的到来，包含学生会改选与新执行部门的动作，学校开始发生些微的变化。有一天，一场骚动来访少女们。为了下一波难题与困难，战车道成员们再次挺身而出迎接挑战。
