故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。
人妖共存又相争的世界，修炼术法、以斩妖除魔为己任的人们被称为妖师。国御妖师队长祁晓轩因一次意外结识了浪子虎子，二人共同踏上除魔卫道的旅途。现如今，世间已历经五百年的平静，妖魔们早已蠢蠢欲动，为他们的前路蒙上阴霾……
河合井小太郎是个初中二年级男生。他小学时制作的史莱姆突然获得了生命，七年来，他一直和这只名叫噗尼露的史莱姆“朋友”愉快地生活在一起。不过，对小太郎来说有个小问题……历经七载光阴，他们都已成长蜕变，而噗尼露更是华丽转身，化身成了绝世美少女！除了美少女形态外，噗尼露还能以史莱姆之身变幻出各种可爱造型。小太郎每天都被她随心所欲的言行搅得心跳加速，前途多舛的日子还在继续。噗尼露和小太郎真的能一直做好朋友，永远快乐地在一起吗！？
