《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
立花萤（小松未可子 配音）是一位拥有着强烈正义感的少女。某日，她搬入了月城庄公寓，准备开始一个人的生活。让住在202室的萤没有想到的是，自己隔壁竟然住了一个名叫松岗正宗（前野智昭 配音）的牛郎，这个举止轻浮油腔滑调的男人没有给萤留下什么好印象。 矢岛鼎（堀江由衣 配音） 是萤唯一的朋友，某日，鼎告诉萤，自己被一个牛郎骗光了所有的积蓄，这让萤愤愤不平。萤冲到了牛郎店想要找到欺骗鼎的那个牛郎，为好友讨回公道，然而，令萤震惊的是，这个牛郎不是别人，正是自己的邻居松岗。而面对萤的挑衅，松岗竟然提出要用枪来一决胜负，就这样，萤被卷入了一个你争我斗的生存游戏之中。
