ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
人妖共存又相争的世界,修炼术法、以斩妖除魔为己任的人们被称为妖师。国御妖师队长祁晓轩因一次意外结识了浪子虎子,二人共同踏上除魔卫道的旅途。现如今,世间已历经五百年的平静,妖魔们早已蠢蠢欲动,为他们的前路蒙上阴霾……
故事发生在一处温馨但偏僻的田园小镇奥木染,双亲过世的少年春日野悠(桥本隆 配音)带着体弱多病的妹妹春日野穹(田口宏子 配音)千里迢迢的来到了这里,准备寄宿在祖父留下的房子中。虽然照顾妹妹的起居很辛苦,但悠还是拥有了一段难得愉快的时光。 在这里,悠遇见了幼年的玩伴天女目瑛(阪田佳代 配音),成熟温柔的姐姐依媛奈绪(猪口有佳 配音),认真可爱的大小姐渚一叶(小野凉子 配音)等热情亲切的朋友们,还有同班损友中里亮平(中国卓郎 配音)的插科打诨让他笑口常开。同时,一些模糊的回忆逐渐的浮上了心头,是和谁有过怎样的约定呢?面对着面前似曾相识的风景,悠的记忆开始苏醒。
因过去的心理阴影而以独自的别扭思考回路讴歌着“独自生活”的比企谷八幡,由于意外的事件而被生活指导担当教师平冢静带去“侍奉部”并加入其中。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃,以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同,从解决班上的人际关系问题到文化祭实行委员的运营,度过着解决各种案件的每一天。时至秋日,八幡等二年级学生前去修学旅行。此时,侍奉部接收到的委托究竟是!?随着新登场的一色彩羽的加入,他们的关系更加错综复杂。——八幡空虚的价值观也有了少许变化,在这些经验过后,他的高中生活又将迎来怎样的展开!?