ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
在某个遥远的星球,全民转职时代来临,副本,秘境,遗迹纷纷出现,危机与机遇共存。男主角魏逍转职成为隐藏职业“亡灵召唤师”,获得SSS级天赋以及超神本命武器,从此之后召唤兽不死他便不灭。其他人还在和小怪打的有来有回,魏逍已经驱使亡灵大军把BOSS彻底淹没。骨海降临,众生臣服,执掌生死,一人成军,从此世间流传着一种说法:魏逍,即是天灾!