ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
在某个遥远的星球，全民转职时代来临，副本，秘境，遗迹纷纷出现，危机与机遇共存。男主角魏逍转职成为隐藏职业“亡灵召唤师”，获得SSS级天赋以及超神本命武器，从此之后召唤兽不死他便不灭。其他人还在和小怪打的有来有回，魏逍已经驱使亡灵大军把BOSS彻底淹没。骨海降临，众生臣服，执掌生死，一人成军，从此世间流传着一种说法：魏逍，即是天灾！
