ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
武道初兴之时,恐怖的异兽入侵,人类武者节节败退。陆圣穿越而来,在梦中进入一万年后的世界:一万年后的基础炼体术,经过改版,效果是现在的几千倍!一万年后的呼吸法、炼体药方、武学圣典…… 让陆圣成为人类唯一的火种!
故事发生在一处温馨但偏僻的田园小镇奥木染,双亲过世的少年春日野悠(桥本隆 配音)带着体弱多病的妹妹春日野穹(田口宏子 配音)千里迢迢的来到了这里,准备寄宿在祖父留下的房子中。虽然照顾妹妹的起居很辛苦,但悠还是拥有了一段难得愉快的时光。 在这里,悠遇见了幼年的玩伴天女目瑛(阪田佳代 配音),成熟温柔的姐姐依媛奈绪(猪口有佳 配音),认真可爱的大小姐渚一叶(小野凉子 配音)等热情亲切的朋友们,还有同班损友中里亮平(中国卓郎 配音)的插科打诨让他笑口常开。同时,一些模糊的回忆逐渐的浮上了心头,是和谁有过怎样的约定呢?面对着面前似曾相识的风景,悠的记忆开始苏醒。